基礎醫學院

藥學院

• 化學生物學系
• 藥物化學系
• 天然藥物學系
• 藥劑學系
• 分子與細胞藥理學系
• 藥事管理與臨床藥學系
• 天然藥物及仿生藥物國家重點實驗室
• 藥學實驗教學中心
• 應用藥物研究所
• 中國藥學（英文版）編輯部

公共衛生學院

• 流行病與衛生統計學系
• 勞動衛生與環境衛生學系
• 營養與食品衛生學系
• 婦幼衛生學系
• 毒理學系
• 衛生政策與管理學系
• 社會醫學與健康教育系
• 衛生檢驗學系
• 全球衛生學系
• 生物統計系
• 北京大學兒童青少年衛生研究所
• 北京大學生育健康研究所
• 衛生部生育健康重點實驗室
• 循證醫學中心
• 艾滋病預防研究中心
• 營養與保健食品評價中心
• 預防醫學實驗教學中心
• 北京大學應急管理中心
• 老年健康服務研究中心

護理學院

• 內外科護理學教研室
• 婦兒科護理學教研室
• 護理學基礎教研室
• 護理學人文教研室
• 社區護理學教研室
• 老年護理康復教研室
• 北京大學護理學實驗教學中心
• 北京大學醫學部循證護理研究中心

醫學人文學院

• 醫學史與醫學哲學系
• 醫學倫理與法律學系
• 醫學心理學系
• 醫學語言文化系
• 健康政治學系/馬克思主義理論教研中心
• 體育與健康系
• 健康信息管理系
• 美學與藝術教育中心
• 研究中心

醫學繼續教育學院

•    北京大學醫學繼續教育學院組建于2017年5月，由原北京大學醫學網絡教育學院（成立于2000年）和原北京大學醫學部在職教育培訓中心（成立于2002年）整合而成，是北京大學開展醫學繼續教育與培訓的重要平臺，與本科生教育、研究生教育相呼應，共同構成“北大醫學”人才培養體系，肩負服務于醫療健康行業、服務于醫學終身教育體系、服務于全社會的時代重任。